Funkce zvláštních zmocněnců jsou zřizovány k systematickému sledování určitého tématu vysoké politické důležitosti, vyžadujícímu vzájemnou informovanost a koordinaci většího počtu útvarů MZV, případně mezirezortní koordinaci. V rozhodnutí o zřízení konkrétní funkce zvláštního zmocněnce ministr stanoví, ve kterém útvaru bude tato funkce zařazena, a vymezí okruh a zaměření činnosti daného zvláštního zmocněnce. Zvláštní zmocněnec zejména:

• jedná s vedoucími příslušných útvarů MZV o realizaci dílčích úkolů k dosahování cílů souvisejících se sledovaným tématem,
• předkládá vedení MZV ke sledovanému tématu informace, analýzy a náměty,
• vede v oblasti své působnosti jednání mimo rezort a na mezinárodní úrovni.

Zvláštní zmocněnci jsou pověřováni funkcí na dobu určitou, a to i opakovaně:

Funkce	Jméno a příjmení	Doba pověření
Zvláštní zmocněnec pro ochranu ekonomických zájmů	Mgr. Tomáš Volf	od 1. 12. 2017 do 30. 11. 2025
Zvláštní zmocněnec pro záležitosti holocaustu, mezináboženský dialog a svobodu vyznání	Mgr. Robert Řehák, Ph.D	od 1. 11. 2019 do 31. 10. 2025
Zvláštní zmocněnec pro krajanské záležitosti	JUDr. Jiří Krátký, M.A.	od 1. 12. 2021 do 30. 11. 2025
Zvláštní zmocněnec pro Indo-Pacifik	Milan Hupcej	od 1.12.2023 do 30. 11. 2025
Zvláštní zmocněnec pro koordinaci politiky vůči Ruské federaci	Mgr. Čeněk Hajný	od 4.9. 2025 do 3.9. 2026
Zvláštní zmocněnec pro Východní partnerství	Ing. David Stulík	od 1. 1. 2024 do 31. 12. 2025
Zvláštní zmocněnkyně pro Sahel	Mgr. Štěpánka Litecká	od 1.9. 2025 do 31. 8. 2026
Zvláštní zmocněnkyně pro Kybernetický prostor	Mgr. Marta Pelechová	od 1.7. 2025 do 30.6. 2026
Zvláštní zmocněnkyně pro vztahy s frankofonními zeměmi	JUDr. Marie Chatardová	od 1.9. 2025 do 31.8. 2026