Od roku 1948 byly československo-japonské vztahy zcela jasně závislé na vývoji vztahů japonsko-sovětských. V roce 1951 Československo s Japonskem nepodepsalo separátní mírovou smlouvu, a mezi oběma zeměmi tak stále neexistovaly diplomatické styky. K jejich obnovení došlo až 13. února 1957, kdy byly rovněž povýšeny na úroveň velvyslanectví. Obnovení diplomatických styků předcházelo společné japonsko-sovětské prohlášení z roku 1956, kterým obě země ukončily přetrvávající válečný stav (mírovou smlouvu Japonsko a Rusko kvůli územním sporům neuzavřely dodnes) a obnovily diplomatické styky. Prvním československým velvyslancem v Japonsku byl jmenován Ladislav Šimovič a japonským velvyslancem v Československu se stal Shiroshichi Kimura.

Obecně lze politické vztahy obou zemí v období 1957-1989 hodnotit jako spíše málo rozvinuté, nicméně bez nějakých výraznější konfliktů. Probíhající spolupráce byla především dílčího charakteru a kromě obchodní sféry se zaměřovala především na oblast vědy, výzkumu a kultury. V politické rovině přelomová a historicky vůbec první oficiální návštěva člena japonské vlády v ČSSR se uskutečnila v polovině roku 1967, kdy do Československa přijel japonský ministr zahraničních věcí Takeo Miki. V září 1967 se pak konalo první jednání ministrů zahraničních věcí, Václava Davida a Takeo Mikiho, v rámci zasedání Valného shromáždění OSN v New Yorku. V říjnu 1967 pak ČSSR navštívil japonský ministr dopravy Jasuhiro Nakasone.

Intervence vojsk zemí Varšavské smlouvy v srpnu 1968 byla Japonskem ostře odsouzena a na dalších několik let byly výrazně omezeny politické styky. Vývoj obchodních vztahů však zůstal nepřerušen a na konci roku 1968 dokonce Japonsko navštívil československý ministr zahraničního obchodu Václav Valeš. Šlo o vůbec první návštěvu člena vlády ČSSR v Japonsku. V roce 1969 navštívil recipročně Československo japonský ministr zahraničního obchodu Masayoshi Ohira. První návštěva na nejvyšší úrovni se u příležitosti konání světové výstavy EXPO uskutečnila až v roce 1970, kdy do Ósaky přijel tehdejší prezident ČSSR Ludvík Svoboda v doprovodu ministra zahraničních věcí Jána Marka.

K obnovení politických kontaktů na úrovni ministrů zahraničních věcí došlo až v roce 1973, kdy oficiální návštěvu Japonska podnikl Bohuslav Chňoupek. Reciproční návštěva japonského ministra Sunao Sonody v ČSSR se uskutečnila o pět let později. V roce 1979 přijel na návštěvu Japonska předseda vlády ČSSR Lubomír Štrougal společně s ministrem zahraničního obchodu Andrejem Barčákem, ministrem pro technický a investiční rozvoj Ladislavem Šupkou a ministrem kultury Milanem Klusákem. Druhá posrpnová návštěva československého ministra zahraničních věcí Bohuslava Chňoupka v Japonsku se uskutečnila v roce 1983. V průběhu 70. a 80. let došlo také k několika oboustranným návštěvám na ministerské úrovni. Jednalo se především o resorty kultury, průmyslu, spojů, stavebnictví a energetiky. V celém poválečném období rovněž proběhlo několik vzájemných návštěv na parlamentní úrovni. Na začátku roku 1989 se pohřbu císaře Hirohita za ČSSR zúčastnil 1. místopředseda vlády Pavol Hrivnák.

Při zpracování textu byly mimo jiné použity informace obsažené v článku Jana Levory uveřejněném v Informačním Bulletinu Deset let česko-japonských vztahů, který v roce 2003 vydalo Velvyslanectví Japonska v ČR.