Přílet pana prezidenta byl naplánován na večer 22. července a hned 23. července začínal jeho program ve městě Himedži, kde byl za jeho přítomnosti podepsáno memorandum o navázání spolupráci mezi hradem Himedži a Pražským hradem. Obě památky jsou zapsány na seznam světového dědictví UNESCO a sdílejí podobné výzvy v oblasti ochrany a správy kulturního dědictví. Ten samý den se prezident přesunul do Hirošimy, kde si připomněl 80. výročí svržení atomové bomby. Uctil památku obětí položením věnce k Mírovému památníku, také navštívil místní muzeum a zapsal se do pamětní knihy. Na programu v Hirošimě byla také návštěva vnitřních prostor Atomového dómu, který navrhl český architekt Jan Letzel. Prezident poté zakončil den na ostrově Mijadžima, kde navštívil chrám Icukušima, který také patří mezi další významné památky UNESCO v Japonsku.

Další den ve středu 24. července se prezident Pavel zúčastnil spolu s Její císařskou Výsostí princeznou Takamado a dalšími japonskými představiteli Národního dne České republiky na světové výstavě EXPO 2025 v Ósace. Tento slavnostní den byl doprovázen bohatým kulturním programem, v němž vystoupila Česká filharmonie, dětský sbor Českého rozhlasu, soubor cirkusu La Putyka a zpěvačka Aiko v rámci projektu The Strings. Prezident se při této příležitosti zapsal do pamětní knihy světové výstavy. Následně se v Českém národním pavilonu zúčastnil dalšího programu.

Následující den 25. července zahájil prezident republiky v Tokiu  Česko-japonské business resillience fórum, které bylo připraveno ve spolupráci s Japan Chamber of Commerce and Industry, Svazem průmyslu a dopravy ČR a Japan Institute for Overseas Investment.

Prezident Petr Pavel dále  absolvoval audienci u Jeho Veličenstva císaře Naruhita. V průběhu dne se rovněž setkal s premiérem Šigeru Išibou. Dalším bodem v prezidentově programu bylo také jeho vystoupení na Tokijské univerzitě na bezpečnostním semináři s tématem „Security Interests of the Indo-Pacific and Europe“. Den zakončil recepcí na Velvyslanectví České republiky v Tokiu, kde se setkal se zástupci krajanské komunity, TUFS akademiky a studenty bohemistiky, představiteli Japonsko-českých společností přátelství a další veřejností podporující česko-japonské vztahy.    

Dne 26. července prezident Petr Pavel odletěl z Japonska. Jeho cesta potvrdila výjimečně dobré vztahy mezi Českem a Japonskem.