Vzájemné vztahy jsou tradičně na dobré úrovni s rostoucí dynamikou v ekonomické oblasti. V posledních letech je důležitým aspektem spolupráce v oblasti bezpečnosti a migrace a v oblasti obrany. 

„Skvěle fungují také projekty ekonomické diplomacie, které pomáhají českým firmám navazovat kontakty s partnery ze Severní Makedonie. Příkladem je firma LOM Praha, která se podílí se na modernizaci vrtulníků podle standardů NATO. Úspěšná je i firma Škoda Auto, která dodala automobily  policii Severní Makedonie,“ uvedl ministr Lipavský. 

Ve vzájemných vztazích nelze opominout ani působení Policie ČR v Severní Makedonii pod hlavičkou FRONTEX. Na základě žádosti ministra vnitra Severní Makedonie byl v prosinci 2015 a v únoru 2016 vyslán do země první kontingent Policie ČR čítající 27 policistů. Český kontingent patřil se třemi desítkami příslušníků dlouhodobě k nejpočetnějším ze všech členských států EU.  

Severní Makedonie si také cení silné podpory Česka rozšiřování EU. „Ujistil jsem ministra Mucunského, že Česko plně podporuje vládu Severní Makedonie v jejím úsilí dosáhnout pokroku v přístupových jednáních. Je však třeba, aby Severní Makedonie prováděla nutné reformy. Součástí tohoto procesu je i vyřešení bilaterálního sporu s Bulharskem a přijetí potřebných změn makedonské ústavy,“ řekl v tomto kontextu šéf české diplomacie.