Salvador a ČR dlouhou dobu neuzavřely žádnou bilaterální dohodu. K podpisu první bilaterální dohody došlo během návštěvy ministra zahraničních věcí J. Kavana v Salvadoru v listopadu 1999, kdy byla podepsána Dohoda o podpoře a ochraně investic mezi Českou republikou a Salvadorskou republikou. Dohoda vstoupila v platnost 28.3.2001. V současně době se jedná o dohodě o zrušení vízové povinnosti pro držitele národních cestovních pasů.

Přehled platných dohod:

Dohoda o vzajemné podpoře a ochraně investic
podepsána v San Salvadoru dne 29.11.1999
vstoupila v platnost 28.3.2001

Dohoda mezi vládou ČR a vládou Salvadoru o zrušení vízové povinnosti
podepsána v San Salvadoru dne 23. 4. 2004