Il Ministro degli Esteri Jan Lipavský ha dichiarato che il Papa è stato una voce di compassione, giustizia e speranza in un mondo tormentato. Secondo il Presidente della Repubblica Petr Pavel il Papa Francesco "ha visto la forza nei valori che a volte dimentichiamo - nella gentilezza, nella fede, nell'umiltà e nella comprensione. Così facendo, ha lasciato un lascito d'ispirazione che continuerà a durare". Il Primo Ministro Petr Fiala ha detto che è stato un uomo di profonda fede che ha cercato di trasformare la Chiesa in modo che potesse svolgere meglio la sua missione nella società contemporanea. Ha mostrato grande preoccupazione per coloro che soffrono di qualsiasi tipo di ingiustizia e emanava l'umanità e umiltà.

I funerali di Papa Francesco si sono svolti il sabato 26 aprile 2025 alle ore 10.00 in Piazza San Pietro. La delegazione ufficiale della Repubblica Ceca era guidata dal Primo Ministro Petr Fiala. Papa Francesco è stato poi deposto per il riposo eterno nella tomba della Basilica Papale di Santa Maria Maggiore a Roma.

I fedeli hanno potuto rendere omaggio alla memoria del Papa in anticipo, nella Basilica di San Pietro, mercoledì 23 aprile 2025, dalle 11.00 alle 24.00, giovedì 24 aprile 2025, dalle 7.00 alle 24.00 e venerdì 25 aprile 2025, dalle 7.00 alle 18.00.